Cпойлер(щелкните, чтобы прочесть):

Эффект будет... отрицательный  ;). Если раньше времени зачистить Свободную Шахту, будут глюки в квесте Ур-Шак, предварительная зачистка кладбища орков привела меня вообще в сюжетному стопору. В общем, не советую.
Единственное, можно зачистить монастырь, но при одном условии - Вы не будете открывать решетку. Чтобы выбраться обратно, можете воспользоваться вторым заклинанием мясного жука, а можете и просто найти путь по пригоркам :)