Я могу сходу придумать кучу квестов которые свяжут основные локации.

Как пример. У бандитов маг Кормак занимается исследованиями. Во второй главе если мы поговорим с ним то узнаем что он подготовил отчет для монастыря о своих исследованиях и отправил рабочего Дуайта (заплатив золотом конечно) отнести пакет с отчетом в монастырь. Но что-то давно нет никаких вестей от него и маг будет нам благодарен если мы попробуем что-то выяснить про это.
С другой стороны если придти в монастырь то Игнатий нам скажет что один магов - *Кормак уже давненько отправился к бандитам для исследования храма и хорошо бы ему прислать о себе какую-то весть. Если мы уже знаем про пакет, то спрашиваем у Игнатия и узнаем что никакого посланника не было.
Отправляемся на поиски и где-то на дороге между монастырем и лагерем бандитов обнаруживаем тело Дуайта. Ни золота, ни пакета у него нет. Но зато рядом валяется трупик гнома. Это наводит на подозрение. Обыскав окрестности, мы находим в пещере банду гномов у которым и пакет с отчетом, и золото.
Ну дальше собственно относим в монастырь пакет и сообщаем Кормаку что все в порядке.
Придумано на коленке за 5 мин. Не понимаю что сложного было реализовать подобное в игре.