И снова мои трудновыполнимые предложения: почему бы не распределить скипты по папкам? Хотя бы основные сделать. Т.е. папка story, в ней npc и missions. Все файлы на b_*.d в папку story/b, все zs_*.d в папку story/zs. Может, ещё что-нибудь придумаем. Остальные файлы пусть остаются где есть